如何查看sra数据

EST : expressed sequences tags 表达序列标签

WGS：whole genome sequencing

miRNA(microRNA): 真核生物中一类内源性的具有调节功能的非编码基因，其大小大约为长度为20-25的核苷酸序列

Run:

Bioproject

Biosample

Experiment

Accession list: 就是run号，可以根据这个号来下载raw data 数据

light, nitrate, phosphate, temperature

1. 登录SRA网页

2. 输入要搜索的物种名字，点击search

   

   3、然后在Send to 下拉框中点击Run Selector, 然后点击Go

   

   4、对搜索出来的结果打钩，如正方形方框所示，然后点击metadata, 就会下载每个run所对应的详细信息

   

   5、对于下载下来的metadata数据，从excel表格打开，选择用逗号隔开，就可以把table数据转化成excel的表格数据。然后用关键词来搜索感兴趣的信息。

3. 另外，可以根据左边的filter来选择相关的信息

   

如何查找一类藻的转录组信息

1、登录sra网站，然后输入一个门的名称，如Dinoflagellates，单击search

2、在右边的信息里，点击tree，就会显示出物种的分类信息，然后点击dinoflagellates, 如下面方框显示所示。

3、勾选好items，然后点击metadata，就下自动下载所有选定run的相关信息。